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1.

Amplification-free detection of SARS-CoV-2 with CRISPR-Cas13a and mobile phone microscopy.

Fozouni, Parinaz; Son, Sungmin; Díaz de León Derby, María; Knott, Gavin J; Gray, Carley N; D'Ambrosio, Michael V; Zhao, Chunyu; Switz, Neil A; Kumar, G Renuka; Stephens, Stephanie I; Boehm, Daniela; Tsou, Chia-Lin; Shu, Jeffrey; Bhuiya, Abdul; Armstrong, Maxim; Harris, Andrew R; Chen, Pei-Yi; Osterloh, Jeannette M; Meyer-Franke, Anke; Joehnk, Bastian; Walcott, Keith; Sil, Anita; Langelier, Charles; Pollard, Katherine S; Crawford, Emily D; Puschnik, Andreas S; Phelps, Maira; Kistler, Amy; DeRisi, Joseph L; Doudna, Jennifer A; Fletcher, Daniel A; Ott, Melanie.

Cell ; 184(2): 323-333.e9, 2021 01 21.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33306959

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7834310
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2020.12.001

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2.

Extracellular Vesicle and Particle Biomarkers Define Multiple Human Cancers.

Hoshino, Ayuko; Kim, Han Sang; Bojmar, Linda; Gyan, Kofi Ennu; Cioffi, Michele; Hernandez, Jonathan; Zambirinis, Constantinos P; Rodrigues, Gonçalo; Molina, Henrik; Heissel, Søren; Mark, Milica Tesic; Steiner, Loïc; Benito-Martin, Alberto; Lucotti, Serena; Di Giannatale, Angela; Offer, Katharine; Nakajima, Miho; Williams, Caitlin; Nogués, Laura; Pelissier Vatter, Fanny A; Hashimoto, Ayako; Davies, Alexander E; Freitas, Daniela; Kenific, Candia M; Ararso, Yonathan; Buehring, Weston; Lauritzen, Pernille; Ogitani, Yusuke; Sugiura, Kei; Takahashi, Naoko; Aleckovic, Masa; Bailey, Kayleen A; Jolissant, Joshua S; Wang, Huajuan; Harris, Ashton; Schaeffer, L Miles; García-Santos, Guillermo; Posner, Zoe; Balachandran, Vinod P; Khakoo, Yasmin; Raju, G Praveen; Scherz, Avigdor; Sagi, Irit; Scherz-Shouval, Ruth; Yarden, Yosef; Oren, Moshe; Malladi, Mahathi; Petriccione, Mary; De Braganca, Kevin C; Donzelli, Maria.

Cell ; 182(4): 1044-1061.e18, 2020 08 20.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32795414

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7522766
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2020.07.009

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3.

Host-Viral Infection Maps Reveal Signatures of Severe COVID-19 Patients.

Bost, Pierre; Giladi, Amir; Liu, Yang; Bendjelal, Yanis; Xu, Gang; David, Eyal; Blecher-Gonen, Ronnie; Cohen, Merav; Medaglia, Chiara; Li, Hanjie; Deczkowska, Aleksandra; Zhang, Shuye; Schwikowski, Benno; Zhang, Zheng; Amit, Ido.

Cell ; 181(7): 1475-1488.e12, 2020 06 25.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32479746

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7205692
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.006

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4.

ORF8 and ORF3b antibodies are accurate serological markers of early and late SARS-CoV-2 infection.

Hachim, Asmaa; Kavian, Niloufar; Cohen, Carolyn A; Chin, Alex W H; Chu, Daniel K W; Mok, Chris K P; Tsang, Owen T Y; Yeung, Yiu Cheong; Perera, Ranawaka A P M; Poon, Leo L M; Peiris, J S Malik; Valkenburg, Sophie A.

Nat Immunol ; 21(10): 1293-1301, 2020 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32807944

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5.

Direct Identification of Hundreds of Expression-Modulating Variants using a Multiplexed Reporter Assay.

Tewhey, Ryan; Kotliar, Dylan; Park, Daniel S; Liu, Brandon; Winnicki, Sarah; Reilly, Steven K; Andersen, Kristian G; Mikkelsen, Tarjei S; Lander, Eric S; Schaffner, Stephen F; Sabeti, Pardis C.

Cell ; 165(6): 1519-1529, 2016 Jun 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27259153

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4957403
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2016.04.027

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6.

Simultaneous profiling of multiple chromatin proteins in the same cells.

Gopalan, Sneha; Wang, Yuqing; Harper, Nicholas W; Garber, Manuel; Fazzio, Thomas G.

Mol Cell ; 81(22): 4736-4746.e5, 2021 11 18.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34637755

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8604773
https://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2021.09.019

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7.

The oncomicropeptide APPLE promotes hematopoietic malignancy by enhancing translation initiation.

Sun, Linyu; Wang, Wentao; Han, Cai; Huang, Wei; Sun, Yumeng; Fang, Ke; Zeng, Zhancheng; Yang, Qianqian; Pan, Qi; Chen, Tianqi; Luo, Xuequn; Chen, Yueqin.

Mol Cell ; 81(21): 4493-4508.e9, 2021 11 04.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34555354

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8.

Mass cytometry: blessed with the curse of dimensionality.

Newell, Evan W; Cheng, Yang.

Nat Immunol ; 17(8): 890-5, 2016 Jul 19.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27434000

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9.

RNA profiles reveal signatures of future health and disease in pregnancy.

Rasmussen, Morten; Reddy, Mitsu; Nolan, Rory; Camunas-Soler, Joan; Khodursky, Arkady; Scheller, Nikolai M; Cantonwine, David E; Engelbrechtsen, Line; Mi, Jia Dai; Dutta, Arup; Brundage, Tiffany; Siddiqui, Farooq; Thao, Mainou; Gee, Elaine P S; La, Johnny; Baruch-Gravett, Courtney; Santillan, Mark K; Deb, Saikat; Ame, Shaali M; Ali, Said M; Adkins, Melanie; DePristo, Mark A; Lee, Manfred; Namsaraev, Eugeni; Gybel-Brask, Dorte Jensen; Skibsted, Lillian; Litch, James A; Santillan, Donna A; Sazawal, Sunil; Tribe, Rachel M; Roberts, James M; Jain, Maneesh; Høgdall, Estrid; Holzman, Claudia; Quake, Stephen R; Elovitz, Michal A; McElrath, Thomas F.

Nature ; 601(7893): 422-427, 2022 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34987224

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8770117
https://dx.doi.org/10.1038/s41586-021-04249-w

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10.

Ferrobotic swarms enable accessible and adaptable automated viral testing.

Lin, Haisong; Yu, Wenzhuo; A Sabet, Kiarash; Bogumil, Michael; Zhao, Yichao; Hambalek, Jacob; Lin, Shuyu; Chandrasekaran, Sukantha; Garner, Omai; Di Carlo, Dino; Emaminejad, Sam.

Nature ; 611(7936): 570-577, 2022 Nov.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36352231

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9645323
https://dx.doi.org/10.1038/s41586-022-05408-3

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11.

A Cell-free DNA Blood-Based Test for Colorectal Cancer Screening.

Chung, Daniel C; Gray, Darrell M; Singh, Harminder; Issaka, Rachel B; Raymond, Victoria M; Eagle, Craig; Hu, Sylvia; Chudova, Darya I; Talasaz, AmirAli; Greenson, Joel K; Sinicrope, Frank A; Gupta, Samir; Grady, William M.

N Engl J Med ; 390(11): 973-983, 2024 Mar 14.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38477985

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12.

Next-Generation Multitarget Stool DNA Test for Colorectal Cancer Screening.

Imperiale, Thomas F; Porter, Kyle; Zella, Julia; Gagrat, Zubin D; Olson, Marilyn C; Statz, Sandi; Garces, Jorge; Lavin, Philip T; Aguilar, Humberto; Brinberg, Don; Berkelhammer, Charles; Kisiel, John B; Limburg, Paul J.

N Engl J Med ; 390(11): 984-993, 2024 Mar 14.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38477986

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13.

AI-based pathology predicts origins for cancers of unknown primary.

Lu, Ming Y; Chen, Tiffany Y; Williamson, Drew F K; Zhao, Melissa; Shady, Maha; Lipkova, Jana; Mahmood, Faisal.

Nature ; 594(7861): 106-110, 2021 06.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33953404

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14.

De novo design of modular and tunable protein biosensors.

Quijano-Rubio, Alfredo; Yeh, Hsien-Wei; Park, Jooyoung; Lee, Hansol; Langan, Robert A; Boyken, Scott E; Lajoie, Marc J; Cao, Longxing; Chow, Cameron M; Miranda, Marcos C; Wi, Jimin; Hong, Hyo Jeong; Stewart, Lance; Oh, Byung-Ha; Baker, David.

Nature ; 591(7850): 482-487, 2021 03.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33503651

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8074680
https://dx.doi.org/10.1038/s41586-021-03258-z

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15.

A pooled testing strategy for identifying SARS-CoV-2 at low prevalence.

Mutesa, Leon; Ndishimye, Pacifique; Butera, Yvan; Souopgui, Jacob; Uwineza, Annette; Rutayisire, Robert; Ndoricimpaye, Ella Larissa; Musoni, Emile; Rujeni, Nadine; Nyatanyi, Thierry; Ntagwabira, Edouard; Semakula, Muhammed; Musanabaganwa, Clarisse; Nyamwasa, Daniel; Ndashimye, Maurice; Ujeneza, Eva; Mwikarago, Ivan Emile; Muvunyi, Claude Mambo; Mazarati, Jean Baptiste; Nsanzimana, Sabin; Turok, Neil; Ndifon, Wilfred.

Nature ; 589(7841): 276-280, 2021 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33086375

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16.

Aerosolization of viable Mycobacterium tuberculosis bacilli by tuberculosis clinic attendees independent of sputum-Xpert Ultra status.

Patterson, Benjamin; Dinkele, Ryan; Gessner, Sophia; Koch, Anastasia; Hoosen, Zeenat; January, Vanessa; Leonard, Bryan; McKerry, Andrea; Seldon, Ronnett; Vazi, Andiswa; Hermans, Sabine; Cobelens, Frank; Warner, Digby F; Wood, Robin.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 121(12): e2314813121, 2024 Mar 19.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38470917

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10962937
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2314813121

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17.

StratoLAMP: Label-free, multiplex digital loop-mediated isothermal amplification based on visual stratification of precipitate.

Jin, Meichi; Ding, Jingyi; Zhou, Yu; Chen, Jiazhao; Wang, Yi; Li, Zida.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 121(2): e2314030121, 2024 Jan 09.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38165933

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10786297
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2314030121

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18.

Label-free and amplification-free viral RNA quantification from primate biofluids using a trapping-assisted optofluidic nanopore platform.

Sampad, Mohammad Julker Neyen; Saiduzzaman, S M; Walker, Zach J; Wells, Tanner N; Wayment, Jesse X; Ong, Ephraim M; Mdaki, Stephanie D; Tamhankar, Manasi A; Yuzvinsky, Thomas D; Patterson, Jean L; Hawkins, Aaron R; Schmidt, Holger.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 121(16): e2400203121, 2024 Apr 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38598338

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC11032468
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2400203121

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19.

Specificity meets function.

Schultze, Joachim L.

Nat Immunol ; 20(12): 1565-1567, 2019 12.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31745339

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20.

Field-resolved infrared spectroscopy of biological systems.

Pupeza, Ioachim; Huber, Marinus; Trubetskov, Michael; Schweinberger, Wolfgang; Hussain, Syed A; Hofer, Christina; Fritsch, Kilian; Poetzlberger, Markus; Vamos, Lenard; Fill, Ernst; Amotchkina, Tatiana; Kepesidis, Kosmas V; Apolonski, Alexander; Karpowicz, Nicholas; Pervak, Vladimir; Pronin, Oleg; Fleischmann, Frank; Azzeer, Abdallah; Zigman, Mihaela; Krausz, Ferenc.

Nature ; 577(7788): 52-59, 2020 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31894146

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